主要研究方向为全球环境变化下海洋生物多样性演化与适应机制，尤其聚焦南海岛礁鱼类多样性形成与演化机理。近年来主要以动物界唯一 “雄性胎生繁殖”的海龙科鱼类为研究对象，取得了一系列原创性成果，揭示了其对典型珊瑚礁生态系统的适应策略与体型形成机制；阐明了海龙科“雄性怀孕”繁殖特征与“免疫耐受平衡”的协同演化机理；并进一步解析了其应对全球环境变化的生理响应分子机制。以第一作者/通讯作者身份在Nature Communications、Science Advances、The Innovation、Science China Life Science等期刊发表论文14篇。主持科技部国家重点研发计划课题、国家自然科学基金重大项目子课题、国家自然科学基金面上项目、青年项目、广东省自然科学基金面上项目共5项，总经费691万元。合著《西南沙岛礁关键造护礁功能生物》等专著2部。

2008年9月 – 2012年6月，新乡医学院，生物技术
2012年9月 – 2017年6月，中山大学，水生生物学

2021年 – 今，中国科学院南海海洋研究所，副研究员
2020年 – 2021年，中国科学院南海海洋研究所，特别研究助理
2018年 – 2020年，中国科学院南海海洋研究所，博士后

关键造礁生物分布与生物礁发育特征, 主持, 科技部国家重点研发计划课题, 2022年-2025年;
粤港澳大湾区陆海相互作用关键过程及生态安全调控机理, 主持, 国家自然科学基金重大项目子课题, 2019年-2023年;
印-太海马种群地理格局分化与繁殖性状演化的遗传调控机制研究, 主持, 国家自然科学基金面上项目, 2023年-2026年;
海马雄激素受体AR的进化特征及其对育儿袋发育的调控机制研究, 主持, 国家自然科学基金青年科学基金项目, 2019年-2021年;
海龙科鱼类雄性怀孕过程育儿袋免疫耐受平衡的演化机制研究, 主持, 广东省基础与应用基础研究基金面上项目, 2021年-2023年。

部分代表性论文与论著如下：
1.Liu Y.#, Qu M.#, Jiang H.#, et al., Roth O. *, Meyer A.*, Lin Q.*, Immunogenetic losses co-occurred with seahorse male pregnancy and mutation in tlx1 accompanied functional asplenia. Nature Communications, 2022, 13:7610;
2.Qu M.#, Liu Y.#, Zhang Y.#, et al., Meyer A.*, Venkatesh B.*, Lin Q.*, Seadragon genome analysis provides insights into its phenotype and sex-determination locus. Science Advances, 2021, 7(34): eabg5196;
3.Wang X.#, Qu M.#, Liu Y.#, et al., Meyer A*, Wang D.,*, Lin Q.*, Genomic basis of evolutionary adaptation in a warm-blooded fish. The Innovation, 2021, 3(1), 100185;
4.Wang Q.#, Liu Y.#, Zhang M.#, et al., Lin Q.*, Qin Q.*, Slc43a2+ T cell metastasis from spleen to brain in RGNNV infected teleost. Science China Life Science, 2024, 67(4): 733-744;
5.Liu Y., Wu Y., Qin G., et al, Lin Q.*, Bioaccumulation and reproductive toxicity of bisphenol A in male-pregnant seahorse (Hippocampus erectus) at environmentally relevant concentrations. Science of the Total Environment, 2021, 753: 141805;
6.Wu Y., Zhang H., Zhang B., Lin Q.*, Liu Y.*, Molecular characterization of TLR22 and its role in immunological modification of the brood pouch of the lined seahorse, Hippocampus erectus. Aquaculture, 2021, 539: 736628;
7.Jiang H., Zhao Z., Yu H., Lin Q.*, Liu Y.*, Evolutionary traits and functional roles of chemokines and their receptors in the male pregnancy of the Syngnathidae, Marine Life Science & Technology, 2023, 5: 500-510;
8.《西南沙岛礁关键造护礁功能生物》, 科学出版社，2019年10月；（参与编写珊瑚礁鱼类章节）.